Les ministères de la Santé et de l'Écologie ont installé un comité national de pilotage chargé de l'élaboration et du suivi du futur plan national sur les résidus de médicaments dans les eaux. Cette initiative vise à se pencher sur la présence de résidus de médicaments humains et vétérinaires, à l'état de traces, dans les eaux de surface et souterraines, dans les rejets d'eaux usées, dans les organismes aquatiques et dans l'eau potable. Se pose également la question de leurs effets sur l'environnement et sur la santé humaine. Deux axes forts ont été proposés pour l'élaboration du plan national : l'évaluation des risques environnementaux et sanitaires, en améliorant les connaissances sur l'état des milieux, sur l'exposition à ces résidus et leurs effets sur l'environnement et la santé ; la gestion de ces risques potentiels par la mise en place de stratégies de réduction visant à réduire les sources de pollution et à renforcer la surveillance.
L'élaboration du plan national constitue un engagement fort du Grenelle de l'environnement et s'inscrit dans le deuxième plan national santé-environnement (PNSE 2).