Deux outils sont désormais disponibles pour aider les gestionnaires dans la caractérisation et le suivi des zones humides. Le « Guide méthodologique d'inventaire et de hiérarchisation des zones humides pour le bassin Rhin-Meuse » met à disposition des clés pour la réalisation d'inventaires. La « Malette d'indicateurs de travaux et de suivis en zones humides », publiée par l'agence de l'eau Loire-Bretagne, est un recueil de 34 fiches pratiques d'indicateurs pour caractériser l'état des zones humides et évaluer les effets des actions de restauration et d'entretien.