Initiée au début des années 2000, avec le rachat du groupe Alcor, la relation entre Séché Environnement et la Caisse des dépôts (CDC) touche à sa fin. Séché a acquis 9 % de son propre capital auprès de la CDC, tandis qu'Amarosa, la holding de Joël Séché, a repris 2 % supplémentaires, soit un montant total de l'ordre de 28 millions d'euros. La CDC revient ainsi à 9,89 % du capital, contre 20 % auparavant. La CDC a indiqué qu'elle gérerait désormais cet actif comme une participation financière, ouvrant la voie à une sortie totale du capital dans les prochains mois. Avec 48,5 % du capital et 57,77 % des droits de vote, Joël Séché sera désormais seul décisionnaire dans son groupe. Les relations entre les deux partenaires s'étaient dégradées avec l'affaire de la Saur. Actionnaire des deux groupes, la CDC, via le FSI, s'était opposée en 2012 au projet de Joël Séché de racheter le groupe de distribution d'eau pour constituer le 3e  groupe intégré, après Veolia et Suez. J.D.