Mayotte est le dernier des douze bassins français à avoir adopté son Sdage. Son budget atteint 170 millions d'euros, dont 100 millions pour l'assainissement et 36 millions pour lutter contre les autres pollutions. Un objectif de 74 % des masses d'eau en très bon état, bon état ou bon potentiel à l'horizon 2015 a été fixé, à comparer aux objectifs nationaux de 66 % du Grenelle environnement