Les laboratoires d'IPL santé environnement durables de Bordeaux et Lille sont les premiers en France à avoir reçu l'accréditation Cofrac pour l'intégralité des substances dangereuses mentionnées dans le programme RSDE. Cela concerne 116 paramètres, micropolluants organiques ou minéraux, sélectionnés par secteur d'activité. Quatre familles de molécules font toutefois exception : chloroalcanes, alkylksphénols, PBDE, hexachloropentadiene. Une dérogation a été accordée en raison du retard pris par les laboratoires dans la maîtrise de ces analyses qui présentent de réelles difficultés techniques.
IPL souligne que les agences de l'eau qui financent 50 % des six campagnes de surveillance initiale n'accorderont leurs subventions que si les exploitants recourent à un laboratoire accrédité Cofrac. L'analyse s'appuie sur plusieurs techniques : LC/MS/MS, GC/MS avec dilution isotopique, dérivation. IPL souligne la nécessité de « privilégier les filières analytiques dédiées beaucoup plus spécifiques que les techniques multirésidus, ici inappropriées ».