Le Comop a listé 80 propositions et identifié quatre domaines d'intervention prioritaires : lutte contre le changement climatique (dont transport, énergie et bâtiment), santé-environnement, biodiversité et l'agriculture et actions transversales. Ces priorités seront dotées d'un milliard d'euros supplémentaire sur la période 2009-2012, notamment mobilisés via le fonds créé par l'Ademe pour financer les démonstrateurs technologiques dans le domaine de l'énergie et les programmes de l'Agence nationale de la recherche (ANR).Le comité préconise également l'élaboration d'une charte nationale de l'expertise, qui aura pour but de généraliser et d'harmoniser les bonnes pratiques en la matière. Valérie Pécresse a souhaité que cette charte soit élaborée dans les six mois, par les opérateurs de recherche, avec l'aide du ministère. Fabian Tubiana, EMLe rapport sur le site du minsitère de la Recherche