La Cour des comptes de l'UE se montre très critique sur l'efficacité des mesures agroenvironnementales de l'UE (2,5 milliards d'euros par an de fonds de l'UE) dans un rapport spécial. Impossible de vérifier si les objectifs définis par les États ont été atteints, ou bien si les liens entre crédits affectés et pressions sur l'environnement sont justifiés. La Cour a identifié aussi des problèmes « considérables » concernant les montants des aides, en particulier en France pour des mesures visant à maintenir des prairies en vue de protéger la biodiversité.